研究团队 合作研究员 辅助中心

Tatsuo Okubo

高级研究学者
Ph.D.
利用数据科学和机器学习手段加速神经学领域的发现和进展
tatsuo.okubo@cibr.ac.cn
教育经历

2015 麻省理工大学,神经生物学博士(Dr. Michale Fee实验室)

2008 东京大学,系统工程硕士

2006 东京大学,系统工程学士

工作经历

2022-    北京脑科学与类脑研究所,高级研究学者

2016-2022    美国哈佛医学院,神经生物学系,博士后 (Dr. Rachel Wilson实验室)


研究概述

近年来,蓬勃涌现的高通量数据采集方法(如大规模电生理记录、多脑区钙成像、脑神经连接组等)将神经学引入了一个大数据的时代。随着海量数据的采集成为可能,随之而来的是在数据分析和结论归纳上的全新挑战。我的团队将致力于运用数据科学和机器学习的前沿手段,来应对各种亟待解决的神经学大数据问题。通过和脑中心其他实验室的紧密合作,我们将开发一系列针对不同数据集种类(包括并不限于高通量神经电生理数据和长期、多个体的行为记录数据)的处理平台。我们将汲取深度学习、概率建模(probabilistic modeling)、机器视觉、图神经网络和强化学习领域的先进算法来构建适合神经学大数据的分析方法。


我们欢迎有共同兴趣的学生、学者和工程师加入我们的团队。

欢迎邮件联系(tatsuo.okubo@cibr.ac.cn)。


荣誉、奖励、学术兼职

2023    人工智能工程师(斯坦福大学)

2020-2022    Warren Alpert 特别学者 (Warren Alpert 基金会)

2017-2020    Helen Hay Whitney 博士后奖金 (Helen Hay Whitney 基金会)

2016–2017    Mahoney 博士后奖金 (哈佛医学院神经生物系)      

2016    Capranica 研究成果奖 (国际神经行为学会)

2013-2014    Hubert Schoemaker 奖学金 (麻省理工脑与认知科学系)

2011    Walle Nauta 优秀教学贡献奖 (麻省理工脑与认知科学系)    

2010    Angus McDonald 优秀助教奖 (麻省理工脑与认知科学系)

2008-2013    中岛奖学金 (中岛记念国际交流财团)

发表文章

(* denotes equal contributions)


1.Basnak MA, Kutschireiter A, Okubo TS, Chen A, Gorelik P, Drugowitsch J, Wilson RI (Nat Neurosci, 2025)

2.Chen P, Yang H, Zheng X, Jia H, Hao J, Xu X, Li C, He X, Chen R, Okubo TS#, Cui Z#. Group-common and individual-specific effects of structure-function coupling in human brain networks with graph neural networks. Imaging Neuroscience (2024)2: 1–21

3.Schlegel P,..., The FlyWire Consortium (Okubo TS),..., Bock DD, Jefferis GSXE. Whole-brain annotation and multi-connectome cell typing of Drosophila. Nature (2024) 634: 139–152

4.Dorkenwald S,..., Seung HS, Murthy M, The FlyWire Consortium (Okubo TS). Neuronal wiring diagram of an adult brain. Nature (2024) 634: 124–138

5. Mukai Y, Okubo TS, Lazarus M, Ono D, Tanaka K, and Yamanaka A, Prostaglandin E2 induces long-lasting inhibition of noradrenergic neurons in the locus coeruleus and moderates the behavioral response to stressors. J Neurosci (2023) 43(47):7982-7999

6. Okubo TS, Patella P, D’Alessandro, Wilson RI, A neural network for wind-guided compass navigation. Neuron (2020) 107(5): 924-40

7. Lynch GF*, Okubo TS*, Hanuschkin A, Hahnloser RHR, Fee MS. Rhythmic continuous-time coding in the songbird analog of vocal motor cortex. Neuron (2016) 90(4): 877-92

8. Okubo TS, Mackevicius EL, Payne HL, Lynch GF, Fee MS. Growth and splitting of neural sequences in songbird vocal development. Nature (2015) 528(7582):352-7

9. Okubo TS, Mackevicius EL, Fee MS. In vivo recording of single-unit activity during singing in zebra finches. Cold Spring Harb Protoc (2014) 2014(12):1273-83